A settembre, il clima in Egitto è generalmente caldo e secco. Da maggio a ottobre, l'Egitto attraversa la sua stagione calda, e il mese di settembre, situato verso la fine di questo periodo, offre condizioni meteorologiche ancora calde ma più moderate rispetto ai mesi precedenti dell'estate.
Il clima in Egitto a settembre è quindi favorevole al viaggio, specialmente per visitare i monumenti storici senza l'affluenza dei mesi invernali. Le temperature variano tra i 25°C e i 35°C, con serate più fresche, soprattutto nel deserto e nelle regioni costiere. Le precipitazioni sono estremamente rare in questo periodo, e il cielo è spesso sereno. Non è il periodo in cui il khamsin soffia per giorni: questo vento si alza soprattutto in primavera e può creare delle pericolose tempeste di sabbia.
Le regioni settentrionali affacciate sulla costa mediterranea, come Alessandria, godono di una rinfrescante brezza marina, mentre il sud, intorno a Luxor e Assuan, rimane più caldo, perfetto per gli amanti del caldo. Il Cairo, situato al centro, registra temperature elevate ma sopportabili grazie all'assenza di piogge e alla bassa umidità. Infine, settembre è uno dei migliori periodi per visitare il deserto del Sahara, poiché le temperature scendono durante la notte, rendendo le escursioni più accessibili.